Muzaffer Akgün 1925 yılında İstanbul'da doğdu. 8-9 yaşlarında keman çalan ve şarkılar mırıldanan Akgün, Ankara bulunan İsmet Paşa Kız Enstitüsü'nü bitirdi. Bestekâr ve Ud sanatçısı olan Şerif İçli'nin teşvikiyle girdiği sınavı kazanarak (1942) Ankara Radyosu'nda sanat hayatına başlar.
Daha sonra İstanbul Radyosu'nda müzik çalışmalarına devam eden Akgün, Türkiye'nin ilk Altın Plak Ödülü alan sanatçısıdır. “Türkülerin Anası” olarak ünlenen, Türkiye'nin “Kışlalar Doldu Bugün” türküsüyle tanıdığı ve sevdiği sanatçı, büyük gazinolarda assolist olarak da sahne aldı.
Gazeteci Haluk Akgün'le evlendikten (1946) sonra daha geniş bir çevreye açılan sanatçı bu dönemde çalışmalarını daha yoğunlaştırdı. 1948 yılında kızı Feryal Akgün dünyaya geldi.
Muzaffer Akgün, hareketli şen havaların yanı sıra uzun havaları da repertuarına eklemiş, okuduğu eserlere duygu katarak, halkın sevdiği bir sanatçı olmuştur. Sevenlerinden gelen yoğun talep üzerine film yapımcıları kendisine teklif götürmüş, teklifi kabul eden sanatçı, 1965 yılı içinde Hulki Saner'in yönettiği, “Ayşecik-Boş Beşik”, “Gurbet Türküsü”, “Soytarı” adlı filmlerde rol almıştır.
Özmüziksan adlı şirket tarafından "Türk halk müziğinde büyük yorumcular ve unutulmayan türküler arşivi"nde bir albümü çıkmıştır ancak maalesef gerisi getirilememiştir. Bu albümde bulunan türküler:
1. adalardan çıktım yayan
2. mihriban
3. bu gün ayın üçüdür
4. çakmağı çak
5. olam boyun gurbanı
6. fırat kenarında
7. eledim eledim
8. kışlalar doldu bugün
9. dolana ay dolana
10. pınar başı ben olayım
11. çayır çimen geze geze
12. antalya'nın mor üzümü
13. kara tren gelmez m'ola
14. garip bir kuştu gönlüm
15. şu uzun gecenin gecesi olsam
16. harman yeri sürerler
